2500年前，著名數學家畢達哥拉斯建立“畢達哥拉斯教團”，試圖用“數學”解釋萬物同時求索人類的信仰與文明，點點星火綿延至2500年後的今日，普通平庸的大學畢業生趙一良古怪的入職“沒有編制”的神秘部門——“朝聖者小隊”，初識一眾個性鮮明的隊員及詭譎的人工智慧，在求索與探尋經歷過多次與音樂繪畫物理化學聲學相關的新奇案件中，平庸的一良逐漸發覺自己的獨特天賦，一步步踏上了自己的朝聖之旅。

初次任務，小隊通過神秘原始的費波那契數列，解開宇辰、熱寂二人設計好 “魯伯特之淚”事件，獲得了神秘裝置——“鬼火”（二人父親宇一甯失蹤前的遺物），從而捲入紛繁複雜的重重謎團之中。

在經歷詭譎的“異手症”兇殺案件後，結識了偽裝為國際刑警漢娜與H的宇辰、熱寂二人。正當一眾線索指向一個絕密檔案——天狼星計畫之際，線索性人物“異手博士”又離奇的密室自殺身亡，同時神秘組織的一名黨羽——掌握音波攻擊方式的“希聲”現身，劫持了曾與宇辰父親宇一甯有過郵件往來的聲學專家蘭容若。

一眾隊員拼死救回蘭容若，但豈料神秘組織調虎離山的真實目的，竟是襲擊“朝聖者”小隊的總部並奪走了“鬼火”，總部“地底空洞”以及AI忒彌斯的所有防線竟在難以置信的極短的時間內被徹底攻克……

層層解謎，線索竟鎖定在“鬼火”自身播放的樂曲與“音流學”的瑰麗圖形呈像之上。

“朝聖者”小隊眾隊員一方面要追擊神秘組織，力爭搶回“鬼火”；另一方面又要找尋“音流”呈像的關鍵物品——克拉尼之板的原物；宇辰、熱寂卻要找尋父親宇一甯的下落；但神秘組織的緣起以及目的又究竟為何？

雪山之巔，千年前教團建造的教堂之中，操控視覺光武器並能將之具象化的金髮美男赫利、掌握嗅覺生化武器的紅發妖豔美女派特拉悉數登場，神秘組織與“朝聖者小隊”羈絆數千年的爭鬥一觸即發，拼死相搏險象環生。

死生之際，神秘組織“光之聲”顯身，一番佈道似的講述，開示了人類信仰與文明、科技間的深邃理解，宇辰確信“光之聲”一定與失蹤的父親有著必然聯繫，同時，神秘組織與“朝聖者”小隊間千絲萬縷、綿延千年的羈絆也抽絲剝繭般的浮現眼前……